pubmed alternatívák
Posted by razor | Filed under Szolgáltatás
Az NCBI PubMed adatbázisa az egyik mindenki által ismert, viszont nem túl átlátható (sőt, szerintem ocsmány kinézetű) cikk és folyóirat kereső adatbázis. Bizonyos mértékben érthető, hogy egy ekkora adatmennyiséghez tartozó felületet nem lehet csak úgy 5 perc alatt átszabni, de azért nem ártana igyekezni, mivel az eddigi kozmetikázások túl sok eredménnyel nem jártak.
Szerencsére azonban az NCBI biztosít egy API-t, amire több alternatív keresőfelület és szolgáltatás épül. Ezek közül szeretnék kettőt röviden bemutatni.
A HubMed az első, nagyon minimalista (és szerintem a legszebb) felülettel és néhány jól használható szolgáltatással. A keresési eredmények rendezése, filterezése és exportja mellett rengeteg egyéb opció akad. Regisztráció után a cikkeket címkézni lehet, a keresési eredmények és maguk a keresések elmenthetők, vagy RSS feed formájában fel lehet rájuk iratkozni. A cikkek kapcsolatai egy kulcsszavas elemzés után vizualizálhatók, ráadásul még egy Firefox keresőplugin és egy bookmarklet is rendelkezésre áll.
A GoPubMed felülete kevésbé tetszik, viszont nagyon hasznos. A keresési eredmények tartalmát elemzi, majd a különféle leírások, kutatók, intézetek, helyek, folyóiratok és időpontok szerint csoportosítja. A legérdekesebb a fogalmak szerinti csoportosítás, ahol a Gene Ontology (GO), Medical Subject Headings (MeSH) és a Universal Protein Resource (UniProt) kategóriái, másrészt fajnevek, kísérleti módszerek, és egyéb fogalmak alapján történik a kategóriákba rendezés. Egy kattintással áttekinthetők a találatok lényegesebb statisztikái, és cikkek exportálása is igen egyszerű.
Alfred D. Eaton (2006) HubMed: a web-based biomedical literature search interface. Nucleic Acids Research 34 (Web Server issue): W745-W747; doi:10.1093/nar/gkl037
Andreas Doms and Michael Schroeder (2005) GoPubMed: exploring PubMed with the Gene Ontology. Nucleic Acids Research 33 (Web Server Issue): W783-W786; doi:10.1093/nar/gki470
Tags: adatbázis, cikkek, gopubmed, hubmed, keresőmotor, pubmed
July 30th, 2009 at 12:44
Váááá, nagyon állat, 1000 kösz!
July 30th, 2009 at 12:46
Az se rossz, hogy automatikusan kiegészíti MeSH term-ökre, ahogy gépelsz. Nem kis időt takarít meg ezzel.
July 30th, 2009 at 14:47
RSS-es kulcsszófigyelőre milyen alternatívák vannak?
(Illetve pusztán “újabb érdekes adat” szintjén, van olyasmi, mint az EurekAlert!, csak témakör szerinti RSS-sel?)
July 31st, 2009 at 08:53
Mármint beírod a keresőbe a kulcsszavakat, és utána jön a feed naponta az új cikkekkel? Arra a HubMed tökéletesen megfelel.
A ScienceDirect-en pedig van valami kategória/témafigyelő, ami hírlevelet és feed-et is ki tud lökni magából, ha jól emlékszem.