diy|synth|bio|art|hacking
Posted by razor | Filed under Biotech, Filozofálás
Na most van ez a mindenféle DIY biológia, szintetikus biológia, bioart, biohacking téma és valójában az egész egy nagy kaotikus, képlékeny ötlet és fogalomhalmaz, minimális mennyiségű alapvető eszközzel és kiforrott koncepcióval.
Én valahogy mindig a különböző elektronikus/digitális művészkedéssel meg a sufnielektronikával állítom párhuzamba. Ott már rengeteg alapeszköz van, a kismillió speciális programozási nyelvtől (Processing) a jól átgondolot elektronikus kütyükig (Arduino) vagy éppen a boltban megvehető marék tranzisztorig, vezetékig és laptopig. Teljesen jól működik a mérnöki gondolkodás, lehet szabványos, egységes eszközöket gyártani, szép specifikációkat írni, nem igazán lesz olyan, hogy “jé, hát ez pont az ellenkezőjét csinálja mint akartam!”.
A bio* témáknál valahogy nem akar működni ez a hozzáállás, hogy lebontom alapvető építőkövekre az élőlényt, sejtet, akármit, aztán a darabokból összelegózom pontosan azt, ami nekem kell. Nem tudom, hogy csak nagyon a kezdeti fázisban járunk és tulajdonképpen túl keveset tudunk, vagy egy akármilyen biológiai rendszer már annyira komplex, hogy mindig lesz egy bizonytalansági tényező, és a végtelenségig közelítjhetük a 100%-ot, de sose érjük el azt a precizitást amit egy mérnök képes létrehozni. Ezek a darabok lennének azok amik a DIYbio, bioart, biohacking projektek létrejöttét nagyban megkönnyítenék az általában drága, lassú és hajtépős labormunka helyett.
Próbáltam összeszedni néhány érdekesebb kezdeményezést, eszközt, ami akár otthon is használható, esetleg a biológiai építőkövek pontos definiálásával küzd.
Elsőnek itt van a LavaAmp nevű házi PCR készülék, nemrég készült el a 0.2-es verzió a Biodesicnél. Hasonló PCR készülék, ami még csak a tervezés fázisában van, az OpenPCR, amit a Kickstarter-en akár támogatni is lehet. Az OpenPCR tervezői követték el az Open Gel Box 2.0 nevű gélelektroforézisre használható cuccot is, amit a Pearl Biotech árusít. Reagensek és kitek vásárlásához kezdésnek meg ott van például a Ginkgo Bioworks, ami már az állítólagos standard biológiai építőkövek kombinálásához ad alapanyagot.
Az építőkövek definiálásával, a kapcsolódó projektek koordinálásával foglalkozik a BioBricks alapítvány. Magukat az építőelemeket az MIT Registry of Standard Biological Parts adatbázis írja le, az iGEM verseny folyamán pedig ezeket kombinálják, javítják, fejlesztik évről évre. A Biofab is hasonló elemeket próbál definiálni.
Tanácsért természetesen rengeteg helyre lehet fordulni, de kezdésnek ott van a DIYbio fóruma, a biopunk.org, amitől nekem is bekattant az agyam, az OpenWetWare wiki, vagy az Open Biohacking Project dokumentumgyűjteménye.
Ezek mellett persze ott van a rengeteg nyílt hozzáférésű cikk, meg a selejtezés a könyvtárakban, laborokban, egyetemeken, jobb esetben kiárusítással, aukciókkal. Az utóbbiban próbál segíteni a DNAdeal is.
Ahonnan pedig semmit nem vártam volna, de mégis: a Microsoft. A Microsoft Biology Foundation egy alapvető eszközcsomagot biztosít DNS, RNS és fehérjeszekvenciák manipulálására és webes szolgáltatásokhoz. A GEC programozási nyelv és a hozzá tartozó fordítóprogram pedig a logikai kapcsolatokat próbálja meg leírni, és formális modelleket felépíteni, amik utána egy paranccsal lefordíthatók DNS-re.
Itt pedig egy nem túl gyakran bővülő twitter lista a fenti témakörökkel foglalkozó emberekkel, említett projektekkel, cégekkel.
Tags: bioart, biohacking, biopunk, biotechnológia, diybio
