adattenger
Posted by razor | Filed under Szolgáltatás
Ugye nem meglepő, hogy egyre nagyobb probléma a mindenféle szekvencia és egyéb kísérletes adatok kezelése, megosztása és elemzése. Két újabb próbálkozás a problémák megoldására a BioTorrents és a DNAnexus. A BioTorrents arra jó, amit a neve is jelez, a bittorrent technológia segít a különböző adatok letöltésében és megosztásában. A torrent előnyeit gondolom nem kell taglalni, [...]
Tags: adat, adatelemzés, biotorrents, bittorrent, dnanexus, illumina, solid, startup
diy bioinf pt 2
Posted by razor | Filed under Bioinformatika
A hasznos és ingyenes eszközök közül az R és a Bioconductor a következő, amit érdemes megemlíteni (és megtanulni). Az R egy adatokkal való bűvészkedésre, statisztikai számításokra és azok grafikus megjelenítésére specializálódott programozási nyelv. A klasszikus statisztikai tesztektől kezdve a nemlineáris modellezésig sokminden elvégezhető a segítségével. Hihetetlen mennyiségű különböző csomag áll rendelkezésre a CRAN adatbázisban, amelyek [...]
Tags: adatelemzés, bioconductor, Bioinformatika, diybio, emboss, linux, r, wemboss
diy bioinf pt 1
Posted by razor | Filed under Bioinformatika
Ha már biopunk és DIYbio, akkor essen néhány szó a bioinformatika részéről is a dolognak, amit jóval könnyebb otthon is csinálni, és még a konyhában sem kell gyanús löttyöket öntögetni mindenfelé, hanem elég egy laptop. Először is az eszközök: ugyan láttam már embert, egézen pontosan egy darabot, aki Windows alatt próbálkozott a bioinformatikával, de azért [...]
Tags: adatelemzés, bash, Bioinformatika, bioperl, diybio, ensembl, gene ontology, linux, perl
