diy bioinf pt 3
Posted by razor | Filed under Bioinformatika
[A while ago I started a series of posts about the basics of bioinformatics, basic tools, programming, etc. It is intended mainly for my hungarian readers, with only limited knowledge in bioinformatics, so the posts are in hungarian.]
Eljutottam odáig, hogy kirakjak még egy kis bioinformatikai alapozást ide, az első két rész itt és itt található. [...]
Tags: Bioinformatika, bioperl, diybio, perl, script
link and video dump
Posted by razor | Filed under English, Linkdump
Cleaning out various link collections, notes, txt files, bookmarks, etc.
Open Researcher Contributor Identification Initiative: an open and independent community effort to standardize researcher identification.
DIY Bio: A Growing Movement Takes on Aging: H+ Magazine reports on the DIYbio movement.
Outlaw Biology at UCLA Symposium: DIYbio blog on the Outlaw Biology symposium at UCLA.
Craig Venter at TEDMED 2009 [...]
Tags: dataviz, design, diybio, genetics, orcid, synthbio, tedmed
diy bioinf pt 2
Posted by razor | Filed under Bioinformatika
A hasznos és ingyenes eszközök közül az R és a Bioconductor a következő, amit érdemes megemlíteni (és megtanulni). Az R egy adatokkal való bűvészkedésre, statisztikai számításokra és azok grafikus megjelenítésére specializálódott programozási nyelv. A klasszikus statisztikai tesztektől kezdve a nemlineáris modellezésig sokminden elvégezhető a segítségével. Hihetetlen mennyiségű különböző csomag áll rendelkezésre a CRAN adatbázisban, amelyek [...]
Tags: adatelemzés, bioconductor, Bioinformatika, diybio, emboss, linux, r, wemboss
diy bioinf pt 1
Posted by razor | Filed under Bioinformatika
Ha már biopunk és DIYbio, akkor essen néhány szó a bioinformatika részéről is a dolognak, amit jóval könnyebb otthon is csinálni, és még a konyhában sem kell gyanús löttyöket öntögetni mindenfelé, hanem elég egy laptop.
Először is az eszközök: ugyan láttam már embert, egézen pontosan egy darabot, aki Windows alatt próbálkozott a bioinformatikával, de azért jóval [...]
Tags: adatelemzés, bash, Bioinformatika, bioperl, diybio, ensembl, gene ontology, linux, perl
bio.display
Posted by razor | Filed under English, Művészkedés
I was browsing for some bioart stuff, when I ran into the blog of Ákos Maróy, and also the bio.display project (located at the domain tyrell.hu, heh).
The original concept of the bio.display project was to create a dynamic display made of genetically modified fluorescent bacteria. The installation, though consisting of millions of living organisms, would [...]
Tags: bacteria, bioart, biodisplay, diybio
miért biopunk
Posted by razor | Filed under Agymenés
Először is azért mert jól hangzik, nem? De. Egyébként pedig a biotechnológia, punk, cyberpunk fogalmakból összegyúrva, ilyen néven létezik egy aránylag kevesek által ismert mozgalom, filozófia és sci-fi műfaj is.
A mozgalom és filozófia középpontjában egyrészt a sufniban genetikai konstrukciókat összerakó, kísérletező műkedvelő áll, mivel bizonyos szintig nem túl nagy kíhívás a DNS/RNS, baktériumok, vírusok, növények [...]
Tags: biopunk, biotechnológia, diybio