open science: doop
Posted by razor | Filed under Bioinformatika, English
The Database of Orthologous Promoters needs some debugging, cleanup, new features and updated data. I decided that I will publish all notes, problems, developments, data, graphs and results here, as an Open Science experiment. First, the main lines of future development are the following, in no particular order. The web search interface needs some debugging, [...]
Tags: database, doop, open science, promóter, redesign
cikkek pt 1
Posted by razor | Filed under Cikkdump
Íme az első cikkhalmaz, amit mostanában találtam és valamennyire felkeltette a figyelmemet. Részletes ismertető általában nem lesz, de azért egy-egy cikk jobban is kivesézésre kerül, ha lesz rá energiám meg időm. A téma nem túl meglepő módon a transzkripció, promóterek, különböző adatbázisok, webes szolgáltatások, microarray elemzés, növényi genomika, és minden ami open access, open data, [...]
Tags: cikkek, database, datasharing, linkek, microarray, motifsearch, promóter
bioperl és motívumok
Posted by razor | Filed under Bioinformatika
A linkek mellett lesz majd egy többé-kevésbé rendszeres szekció a transzkripcióval, promóterekkel, promóter elemzéssel, motívumkereső módszerekkel, adatbázisokkal foglalkozó aktuális cikkekről is. Bevezetésnek itt egy tavalyi előadás, hátha. A hülye címet nem én találtam ki.
Tags: bioperl, dns, előadás, motívum, promóter, transzkripció
doop és doopsearch
Posted by razor | Filed under Bioinformatika
Mivel sokan és sokszor kínoztak már olyan kérdésekkel, hogy mit is csinálok, szépen sorban bemutatom a különféle témákat. Itt az első, lebutítva átlag halandók szintjére. A legrégebbi, amivel kezdtem, és amin keresztül megtanultam sok, biológushoz méltatlan (te biológus vagy és programozol, bazmeeeg?) dolgot, egy adatbázis és a hozzá tartozó keresőfelület fejlesztése volt. A neve Database [...]
Tags: adatbázis, Bioinformatika, dns, promóter
