szoftverpublikálás
Posted by razor | Filed under Bioinformatika, Filozofálás
Már rágódtam rajta, hogy a klasszikus cikkek publikálása mellett a különféle adatokat és programokat is valami átláthatóbb rendszerben kéne a műértő közönség elé tárni. Most a különféle bioinformatikában, biológiában, vagy egyéb természettudományos területen használt és fejlesztett szoftverekről lesz szó. Boscoh hasonló dolgokról ír egyébként, csak hamarabb jutott a gép elé.
Gondolom nem ismeretlen szituáció, hogy valaki [...]
Tags: peer-review, publikálás, szoftver
supp.mat.
Posted by razor | Filed under Bioinformatika, Szolgáltatás
Lassan sikerül a végére érnünk egy cikknek, és a különféle mellékletek pofozgatása közben jutott eszembe, hogy a supplementary material-ként csatolt adatsorok kezelése általában milyen nehézkes. Ide ugye azok az adatok kerülnek, amik a cikkbe már nem férnek bele, alapvetően a méretük miatt. A részletes módszerleírásoktól eltekintve általában különféle táblázatokról, összesítésekről van szó, amiket gusztustalan excel [...]
Tags: adat, adatbázis, excel, factual, many eyes, openwetware, publikálás
cikk szintű statisztikák
Posted by razor | Filed under Szolgáltatás
A PLoS a mai nappal az összes folyóiratánál bevezette a különböző cikk szintű statisztikák használatát. A bejelentés itt található, ezen az oldalon pedig némileg részletezik, mit is értenek cikk szintű statisztika alatt. A statisztikák, módszerek és részletes adatok teljesen transzparensek és szabadon letölthetők itt [zip]. Lassan talán sikerül kiszakadni az impakt faktor bűvköréből, és nem [...]
Tags: IF, impakt faktor, plos, publikálás, statisztika
openid kutatóknak
Posted by razor | Filed under Bioinformatika, Szolgáltatás
A folyóirat/cikk publikálás változásaival együtt lassan, de biztosan változik az is, hogy egy kutató “output”-ját hogyan értékeljük, és ami szintén igen lényeges, hogyan gyűjtjük össze, milyen statisztikákkal rendelkezünk róla. Cikkek esetében már ott van a DOI (Digital Object Identifier), ami egyértelműen beazonosít egy irományt, akkor is ha annak helye és/vagy tartalma változik, kutatóknál azonban még [...]
Tags: doi, openid, publikálás, researcherid
open src, science, data
Posted by razor | Filed under Bioinformatika, Filozofálás
Az elmúlt néhány évben a tudományos folyóiratkiadás területén elég nagy változások történtek, történnek, de ez nem újdonság. Az open access újságoktól kezdve egészen addig, hogy néhányan végre kijelentették, az impakt faktor, és az arra alapuló bírálati rendszerek márpedig szarok, a Nature cikk valójában semmire sem garancia, se a kutatás színvonalára, se annak fontosságára. Az összesített [...]
Tags: adat, Bioinformatika, IF, internet, peer-review, publikálás, szoftver, Szolgáltatás